热带海洋学报

作者：黄景, 欧泽奎, 刘文广, 何毛贤

单位：1.中国科学院南海海洋研究所, 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室, 广东省应用海洋生物学重点实验室, 中国科学院南海生态环境工程创新研究院, 广东 广州 510301；2.中国科学院大学, 北京 100049

关键词：特异性位点扩增片段,塔形马蹄螺(Tectus pyramis),遗传结构,种质资源,

基金：Strategic Priority Research Program of the Chinese Academy of Sciences(XDA13020206);Innovation Academy of South China Sea Ecology and Environmental, Engineering, Chinese Academy of Sciences(ISEE2018PY03);Innovation Academy of South China Sea Ecology

塔形马蹄螺(Tectus pyramis), 海洋软体动物, 广泛分布于中国深圳大鹏湾、海南岛、西沙和南沙群岛的珊瑚礁生态系统中。文章采用特异性位点扩增片段简化基因组测序技术(SLAF-seq)对来自深圳(SZ)、三亚(SY)和西沙(XS)的塔形马蹄螺群体的遗传多样性和结构进行分析。通过测序共获得115.74Mb读长数据, 平均测序深度为337.87倍, 测序质量值(Q30)平均为94.07%。研究获得118679个多态性SLAF标签, 获得846502个高度一致的群体单核苷酸多态性位点(SNPs), 其中有155个显著差异SNPs。3个群体的平均观察杂合度(Ho)和期望杂合度(He)值分别为0.1441~0.1611和0.2537~0.2695。平均多态性信息含量(PIC)为0.2048~0.2176。通过系统发育树分析、主成分分析和聚类分析, 将45个个体大致分为3个类群, 每个群体的所有个体都可以聚类成一个类群。SZ和SY群体的遗传结构相似, 遗传距离最低(0.2510), 遗传分化系数Fst值最低(0.0818)。但XS与其他两个群体间的遗传分化明显, 尤其是XS和SZ群体(Fst=0.1868)。3个群体的遗传分化可能与海流和地理位置有关。

来源：2020年第5期

《热带海洋学报》期刊编辑部

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