热带海洋学报

作者：王鹏霞, 赵逸, 杜晓飞, 王伟权, 王晓雪

单位：1.中国科学院南海海洋研究所, 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室, 广东 广州 510301；2.南方海洋科学与工程广东省实验室(广州), 广东 广州 511458；3.中国科学院大学, 北京 100049；4.三亚海洋生态环境工程研究院, 海南 三亚 572000；5.河北师范大学, 生命科学学院, 河北 石家庄 050024

关键词：海洋细菌,假交替单胞菌,基因岛,泳动能力,环境适应性,

基金：海南省科技计划三亚崖州湾科技城联合项目(320LH047); 广东省自然科学基金项目(2019A1515011912); 广州市科技计划项目(202002030493)

海洋细菌由于所处环境的复杂性和多变性, 进化出独特的环境适应机制。基因岛通常携带宿主细菌环境适应性有关的基因, 在推动细菌环境适应性和基因组多样化中起重要作用。假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)在各种海洋生境中广泛分布, 具有重要的工业应用价值和生态修复潜力。文章以深海沉积物中分离的假交替单胞菌SM9913为研究对象, 通过与表层海水中分离的假交替单胞菌TAC125进行比较基因组学分析, 发现SM9913基因组上yicC基因内部整合了一个18kb的基因岛, 我们命名为GIPspSM9913。该基因岛编码整合酶、切离酶以及多套限制修饰系统。数据库检索分析发现GIPspSM9913同源的基因岛在假交替单胞菌、希瓦氏菌(Shewanella)、弧菌(Vibrio)和气单胞菌(Aeromonas)等细菌中广泛存在。定量PCR结果显示, 当切离酶表达时, GIPspSM9913会从基因组上大量切离, 产生无基因岛的SM9913突变株。测序分析表明, GIPspSM9913的切除不会影响整合位点侧翼基因的表达。比较切离突变株与野生菌的运动能力、电转化频率和接合转移效率等, 发现GIPspSM9913可以提高宿主细菌的泳动能力和对外源DNA入侵的抵御能力。

来源：2023年第2期

《热带海洋学报》期刊编辑部

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