热带海洋学报

作者：吴贵清, 李瑞华, 肖意豪, 陈彦林, 罗璇, 刘相全, 朱佳杰, 吴雪萍

单位：1.广西民族大学海洋与生物技术学院, 广西 南宁 530007；2.广西壮族自治区水产技术推广站, 广西 南宁 530016；3.山东省海洋生态修复重点实验室(山东省海洋资源与环境研究院), 山东 烟台 264006

关键词：缢蛏,微卫星,遗传多样性,遗传分化,

基金：广西民族大学引进人才启动基金(2017KJQD007); 广西自然科学基金资助项目(2020GXNSFBA159010); 2022年广西壮族自治区大学生创新创业训练计划项目(S202210608162); 2022年广西壮族自治区大学生创新创业训练计划项目(S202210608163); 2023年广西壮族自治区大学生创新创业训练计划项目(S202310608040)

利用基于简化基因组测序(restriction site associated DNA sequencing, RAD-seq)技术开发了10对新的多态性微卫星引物, 对辽宁丹东(DD)、河北秦皇岛(QHD)、辽宁庄河(ZH)、山东青岛(QD)、江苏连云港(LYG)、浙江宁波(NB)、福建厦门(XM)、广东惠州(HZ)和广西北海(BH)共9个缢蛏群体进行了遗传多样性分析, 在270个缢蛏个体中共检测到了352个等位基因。平均等位基因数(Na, number of alleles)在3.2000~4.3000之间、平均有效等位基因数(Ne, effective number of alleles)在1.8789~2.5433之间; 观测杂合度(Ho, observed heterozygosity)范围为0.0000~0.9667、平均观测杂合度在0.3088~0.5533之间; 期望杂合度(He, expected heterozygosity)范围为0.0000~0.7945、平均期望杂合度在0.3456~0.5715之间; 平均多态信息含量(PIC, polymorphic information content)在0.3373~0.5989之间。遗传多样性评估显示, 9个缢蛏群体的遗传多样性水平属于中等。群体间的遗传分化系数(Fst, genetic differentiation coefficient)在0.0547~0.3511之间, 其中QHD和ZH群体之间的Fst值最低为0.0547, 而LYG和BH群体之间的Fst值最高为0.3511。基因流(Nm, gene flow)在0.4620至4.3204之间, 其中QHD和ZH群体之间的Nm值最高为4.3204, 而LYG和BH群体之间的Nm值最低为0.4620。分子方差分析(analysis of molecular variance, AMOVA)分析结果显示, 群体间的遗传变异占总变异的33.04% (p < 0.01), 而群体内的遗传变异占总变异的66.96% (p < 0.01), 表明遗传变异不仅存在于个体间, 也存在于群体间, 但个体间的遗传变异大于群体间的遗传变异。非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means, UPGMA)、Structure软件的聚类结果以及主坐标分析(principal coordinate analysis, PCoA)结果一致。研究结果显示, 9个缢蛏群体可分为3大支: 第一支由QHD、ZH、QD、DD 4个群体组成; 第二支由LYG、NB、XM、HZ 4个群体组成; 第三支由BH群体独立成支。

来源：2025年第2期

《热带海洋学报》期刊编辑部

查看热带海洋学报杂志2025年第2期